Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP7P55210 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP7P55210 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP7P55210 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP7P55210 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP7P55210 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP7P55210 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CASP7P55210 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASP7P55210 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CASP7P55210 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASP7P55210 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CASP7P55210 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CASP7P55210 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASP7P55210 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CASP7P55210 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CASP7P55210 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CASP7P55210 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CASP7P55210 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASP7P55210 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CASP7P55210 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CASP7P55210 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASP7P55210 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP7P55210 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP7P55210 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP7P55210 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP7P55210 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP7P55210 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP7P55210 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP7P55210 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP7P55210 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP7P55210 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP7P55210 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP7P55210 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP7P55210 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP7P55210 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP7P55210 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP7P55210 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP7P55210 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP7P55210 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP7P55210 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP7P55210 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP7P55210 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP7P55210 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP7P55210 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP7P55210 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP7P55210 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP7P55210 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP7P55210 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP7P55210 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP7P55210 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP7P55210 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP7P55210 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP7P55210 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP7P55210 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP7P55210 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP7P55210 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP7P55210 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP7P55210 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP7P55210 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP7P55210 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP7P55210 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP7P55210 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP7P55210 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP7P55210 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP7P55210 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP7P55210 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP7P55210 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP7P55210 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP7P55210 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP7P55210 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP7P55210 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP7P55210 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP7P55210 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP7P55210 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP7P55210 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP7P55210 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP7P55210 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP7P55210 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP7P55210 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP7P55210 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP7P55210 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CASP7P55210 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP7P55210 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP7P55210 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP7P55210 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP7P55210 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP7P55210 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP7P55210 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP7P55210 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP7P55210 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP7P55210 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP7P55210 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP7P55210 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP7P55210 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP7P55210 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP7P55210 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP7P55210 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP7P55210 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP7P55210 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP7P55210 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms