Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms