Protein–RNA interactions for Protein: P53903

PGA2, Processing of GAS1 and ALP protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PGA2P53903 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.3□□□□□ -2.36
PGA2P53903 RAD34YDR314C 2079 nt0.29□□□□□ -2.36
PGA2P53903 SNU56YDR240C 1479 nt0.29□□□□□ -2.36
PGA2P53903 SBH1YER087C-B 249 nt0.28□□□□□ -2.36
PGA2P53903 BSC3YLR465C 309 nt0.28□□□□□ -2.36
PGA2P53903 BIG1YHR101C 1008 nt0.27□□□□□ -2.37
PGA2P53903 YIR044CYIR044C 186 nt0.27□□□□□ -2.37
PGA2P53903 IQG1YPL242C 4488 nt0.26□□□□□ -2.37
PGA2P53903 TIM13YGR181W 318 nt0.26□□□□□ -2.37
PGA2P53903 CUL3YGR003W 2235 nt0.25□□□□□ -2.37
PGA2P53903 YPL185WYPL185W 396 nt0.25□□□□□ -2.37
PGA2P53903 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.24□□□□□ -2.37
PGA2P53903 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.24□□□□□ -2.37
PGA2P53903 snR72snR72 98 nt0.24□□□□□ -2.37
PGA2P53903 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.24□□□□□ -2.37
PGA2P53903 MLP1YKR095W 5628 nt0.24□□□□□ -2.37
PGA2P53903 BEM3YPL115C 3387 nt0.24□□□□□ -2.37
PGA2P53903 FYV10YIL097W 1551 nt0.23□□□□□ -2.37
PGA2P53903 PET111YMR257C 2403 nt0.23□□□□□ -2.37
PGA2P53903 YBR064WYBR064W 429 nt0.23□□□□□ -2.37
PGA2P53903 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.21□□□□□ -2.38
PGA2P53903 INP2YMR163C 2118 nt0.21□□□□□ -2.38
PGA2P53903 PBI2YNL015W 228 nt0.21□□□□□ -2.38
PGA2P53903 YCR001WYCR001W 315 nt0.2□□□□□ -2.38
PGA2P53903 OLI1Q0130 231 nt0.2□□□□□ -2.38
PGA2P53903 snR51snR51 107 nt0.2□□□□□ -2.38
PGA2P53903 MLP2YIL149C 5040 nt0.19□□□□□ -2.38
PGA2P53903 MCM10YIL150C 1716 nt0.19□□□□□ -2.38
PGA2P53903 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.19□□□□□ -2.38
PGA2P53903 NFU1YKL040C 771 nt0.19□□□□□ -2.38
PGA2P53903 VIK1YPL253C 1944 nt0.19□□□□□ -2.38
PGA2P53903 YAP6YDR259C 1152 nt0.18□□□□□ -2.38
PGA2P53903 EMC4YGL231C 573 nt0.18□□□□□ -2.38
PGA2P53903 ESP1YGR098C 4893 nt0.17□□□□□ -2.38
PGA2P53903 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.16□□□□□ -2.38
PGA2P53903 SDH7YDR511W 402 nt0.15□□□□□ -2.39
PGA2P53903 PTP2YOR208W 2253 nt0.14□□□□□ -2.39
PGA2P53903 YDL011CYDL011C 324 nt0.14□□□□□ -2.39
PGA2P53903 PAA1YDR071C 576 nt0.14□□□□□ -2.39
PGA2P53903 YLR269CYLR269C 351 nt0.14□□□□□ -2.39
PGA2P53903 ASE1YOR058C 2658 nt0.14□□□□□ -2.39
PGA2P53903 RPS20YHL015W 366 nt0.13□□□□□ -2.39
PGA2P53903 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.13□□□□□ -2.39
PGA2P53903 GPI15YNL038W 690 nt0.13□□□□□ -2.39
PGA2P53903 YBR206WYBR206W 324 nt0.13□□□□□ -2.39
PGA2P53903 YFL012WYFL012W 447 nt0.12□□□□□ -2.39
PGA2P53903 YBL071CYBL071C 309 nt0.12□□□□□ -2.39
PGA2P53903 SPO21YOL091W 1830 nt0.11□□□□□ -2.39
PGA2P53903 MAM33YIL070C 801 nt0.11□□□□□ -2.39
PGA2P53903 BIR1YJR089W 2865 nt0.11□□□□□ -2.39
PGA2P53903 YJR011CYJR011C 786 nt0.1□□□□□ -2.39
PGA2P53903 RPF1YHR088W 888 nt0.09□□□□□ -2.4
PGA2P53903 YML108WYML108W 318 nt0.09□□□□□ -2.4
PGA2P53903 YNL058CYNL058C 951 nt0.09□□□□□ -2.4
PGA2P53903 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.09□□□□□ -2.4
PGA2P53903 SEC8YPR055W 3198 nt0.08□□□□□ -2.4
PGA2P53903 HAL9YOL089C 3093 nt0.08□□□□□ -2.4
PGA2P53903 COX5BYIL111W 456 nt0.08□□□□□ -2.4
PGA2P53903 YPL229WYPL229W 621 nt0.08□□□□□ -2.4
PGA2P53903 NIP100YPL174C 2607 nt0.08□□□□□ -2.4
PGA2P53903 PRP5YBR237W 2550 nt0.07□□□□□ -2.4
PGA2P53903 OST4YDL232W 111 nt0.07□□□□□ -2.4
PGA2P53903 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.07□□□□□ -2.4
PGA2P53903 YKL123WYKL123W 381 nt0.05□□□□□ -2.4
PGA2P53903 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.05□□□□□ -2.4
PGA2P53903 YLR287CYLR287C 1068 nt0.05□□□□□ -2.4
PGA2P53903 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.05□□□□□ -2.4
PGA2P53903 YHL041WYHL041W 450 nt0.04□□□□□ -2.4
PGA2P53903 PRP42YDR235W 1635 nt0.04□□□□□ -2.4
PGA2P53903 BUL2YML111W 2763 nt0.03□□□□□ -2.4
PGA2P53903 ATG31YDR022C 591 nt0.03□□□□□ -2.4
PGA2P53903 EAF6YJR082C 342 nt0.03□□□□□ -2.4
PGA2P53903 COX12YLR038C 252 nt0.03□□□□□ -2.4
PGA2P53903 ZEO1YOL109W 342 nt0.03□□□□□ -2.4
PGA2P53903 YHR125WYHR125W 306 nt0.02□□□□□ -2.41
PGA2P53903 STE5YDR103W 2754 nt0.02□□□□□ -2.41
PGA2P53903 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.01□□□□□ -2.41
PGA2P53903 YNL319WYNL319W 441 nt0.01□□□□□ -2.41
PGA2P53903 YNL211CYNL211C 261 nt0□□□□□ -2.41
PGA2P53903 RCO1YMR075W 2055 nt-0.02□□□□□ -2.41
PGA2P53903 YER084W-AYER084W-A 513 nt-0.02□□□□□ -2.41
PGA2P53903 snR45snR45 172 nt-0.02□□□□□ -2.41
PGA2P53903 DIE2YGR227W 1578 nt-0.02□□□□□ -2.41
PGA2P53903 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt-0.03□□□□□ -2.41
PGA2P53903 YKL083WYKL083W 615 nt-0.03□□□□□ -2.41
PGA2P53903 YLR171WYLR171W 390 nt-0.03□□□□□ -2.41
PGA2P53903 ORC3YLL004W 1851 nt-0.04□□□□□ -2.42
PGA2P53903 THO2YNL139C 4794 nt-0.05□□□□□ -2.42
PGA2P53903 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt-0.05□□□□□ -2.42
PGA2P53903 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt-0.05□□□□□ -2.42
PGA2P53903 YOR053WYOR053W 342 nt-0.06□□□□□ -2.42
PGA2P53903 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt-0.06□□□□□ -2.42
PGA2P53903 snR78snR78 87 nt-0.07□□□□□ -2.42
PGA2P53903 RPS26AYGL189C 360 nt-0.07□□□□□ -2.42
PGA2P53903 AIM29YKR074W 468 nt-0.07□□□□□ -2.42
PGA2P53903 UTP8YGR128C 2142 nt-0.08□□□□□ -2.42
PGA2P53903 YHR130CYHR130C 336 nt-0.08□□□□□ -2.42
PGA2P53903 YML007C-AYML007C-A 111 nt-0.08□□□□□ -2.42
PGA2P53903 YOR345CYOR345C 351 nt-0.08□□□□□ -2.42
PGA2P53903 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.2 ms