Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNP53814 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNP53814 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNP53814 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNP53814 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNP53814 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNP53814 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNP53814 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNP53814 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNP53814 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNP53814 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNP53814 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNP53814 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNP53814 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNP53814 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNP53814 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNP53814 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNP53814 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNP53814 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNP53814 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNP53814 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNP53814 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNP53814 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNP53814 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNP53814 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNP53814 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNP53814 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNP53814 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNP53814 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNP53814 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNP53814 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNP53814 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNP53814 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNP53814 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNP53814 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNP53814 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNP53814 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNP53814 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNP53814 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNP53814 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNP53814 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNP53814 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNP53814 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNP53814 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNP53814 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNP53814 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNP53814 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNP53814 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNP53814 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNP53814 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNP53814 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNP53814 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNP53814 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNP53814 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNP53814 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNP53814 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNP53814 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNP53814 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNP53814 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNP53814 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNP53814 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNP53814 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNP53814 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNP53814 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNP53814 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNP53814 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNP53814 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNP53814 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNP53814 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNP53814 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNP53814 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNP53814 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNP53814 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNP53814 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNP53814 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNP53814 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNP53814 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNP53814 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNP53814 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNP53814 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNP53814 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNP53814 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNP53814 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNP53814 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNP53814 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNP53814 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNP53814 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNP53814 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNP53814 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNP53814 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNP53814 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNP53814 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNP53814 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNP53814 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNP53814 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNP53814 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNP53814 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNP53814 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNP53814 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNP53814 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms