Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSBP53539 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSBP53539 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSBP53539 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSBP53539 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSBP53539 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSBP53539 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSBP53539 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSBP53539 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSBP53539 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSBP53539 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSBP53539 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSBP53539 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSBP53539 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSBP53539 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSBP53539 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSBP53539 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSBP53539 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSBP53539 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSBP53539 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSBP53539 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOSBP53539 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOSBP53539 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOSBP53539 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOSBP53539 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOSBP53539 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOSBP53539 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOSBP53539 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOSBP53539 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOSBP53539 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOSBP53539 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOSBP53539 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FOSBP53539 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FOSBP53539 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FOSBP53539 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOSBP53539 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOSBP53539 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOSBP53539 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOSBP53539 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOSBP53539 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOSBP53539 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOSBP53539 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOSBP53539 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOSBP53539 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOSBP53539 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOSBP53539 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOSBP53539 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOSBP53539 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOSBP53539 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOSBP53539 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOSBP53539 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOSBP53539 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOSBP53539 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOSBP53539 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOSBP53539 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOSBP53539 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOSBP53539 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOSBP53539 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOSBP53539 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOSBP53539 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOSBP53539 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOSBP53539 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOSBP53539 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOSBP53539 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FOSBP53539 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FOSBP53539 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOSBP53539 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOSBP53539 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOSBP53539 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOSBP53539 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOSBP53539 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOSBP53539 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOSBP53539 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FOSBP53539 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOSBP53539 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSBP53539 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSBP53539 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSBP53539 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSBP53539 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSBP53539 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSBP53539 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSBP53539 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSBP53539 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSBP53539 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSBP53539 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSBP53539 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSBP53539 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSBP53539 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSBP53539 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSBP53539 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSBP53539 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSBP53539 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSBP53539 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSBP53539 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSBP53539 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSBP53539 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSBP53539 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOSBP53539 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOSBP53539 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOSBP53539 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms