Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNI2P48788 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNI2P48788 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms