Protein–RNA interactions for Protein: P43539

YFL065C, Uncharacterized protein YFL065C, yeastyeast

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YFL065CP43539 YJR011CYJR011C 786 nt0.33□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 BSC3YLR465C 309 nt0.33□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 YML003WYML003W 873 nt0.33□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 YBL108WYBL108W 306 nt0.33□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 YBR206WYBR206W 324 nt0.33□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 TTI1YKL033W 3117 nt0.32□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 NUP192YJL039C 5052 nt0.32□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 PMP1YCR024C-A 123 nt0.32□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 YDR426CYDR426C 378 nt0.32□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 YHL042WYHL042W 453 nt0.32□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.32□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 PAN2YGL094C 3348 nt0.32□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 PRP16YKR086W 3216 nt0.32□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 NOP9YJL010C 2001 nt0.31□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.31□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.31□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.31□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.31□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.31□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.31□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.31□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.31□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.31□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.31□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.31□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 YIR044CYIR044C 186 nt0.31□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 YCK3YER123W 1575 nt0.31□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 ATG31YDR022C 591 nt0.3□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.3□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 ATP19YOL077W-A 207 nt0.3□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.3□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.29□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.28□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 PTP2YOR208W 2253 nt0.28□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 MRPL50YNR022C 420 nt0.28□□□□□ -2.36
YFL065CP43539 SBH1YER087C-B 249 nt0.27□□□□□ -2.37
YFL065CP43539 CLU1YMR012W 3834 nt0.27□□□□□ -2.37
YFL065CP43539 YOR218CYOR218C 420 nt0.27□□□□□ -2.37
YFL065CP43539 FMP27YLR454W 7887 nt0.26□□□□□ -2.37
YFL065CP43539 YMR321CYMR321C 318 nt0.26□□□□□ -2.37
YFL065CP43539 YNL211CYNL211C 261 nt0.26□□□□□ -2.37
YFL065CP43539 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.26□□□□□ -2.37
YFL065CP43539 SPO21YOL091W 1830 nt0.26□□□□□ -2.37
YFL065CP43539 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.25□□□□□ -2.37
YFL065CP43539 SGF11YPL047W 300 nt0.25□□□□□ -2.37
YFL065CP43539 YPL068CYPL068C 882 nt0.25□□□□□ -2.37
YFL065CP43539 NIP100YPL174C 2607 nt0.24□□□□□ -2.37
YFL065CP43539 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.24□□□□□ -2.37
YFL065CP43539 YLR434CYLR434C 384 nt0.24□□□□□ -2.37
YFL065CP43539 YLR456WYLR456W 615 nt0.24□□□□□ -2.37
YFL065CP43539 PET111YMR257C 2403 nt0.24□□□□□ -2.37
YFL065CP43539 IML1YJR138W 4755 nt0.23□□□□□ -2.37
YFL065CP43539 PAA1YDR071C 576 nt0.23□□□□□ -2.37
YFL065CP43539 PCC1YKR095W-A 267 nt0.23□□□□□ -2.37
YFL065CP43539 ABF2YMR072W 552 nt0.23□□□□□ -2.37
YFL065CP43539 FYV10YIL097W 1551 nt0.23□□□□□ -2.37
YFL065CP43539 YSP1YHR155W 3687 nt0.22□□□□□ -2.37
YFL065CP43539 PAU12YGR294W 363 nt0.21□□□□□ -2.38
YFL065CP43539 YAR029WYAR029W 225 nt0.21□□□□□ -2.38
YFL065CP43539 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt0.21□□□□□ -2.38
YFL065CP43539 YOR053WYOR053W 342 nt0.21□□□□□ -2.38
YFL065CP43539 BEM3YPL115C 3387 nt0.21□□□□□ -2.38
YFL065CP43539 ASE1YOR058C 2658 nt0.2□□□□□ -2.38
YFL065CP43539 PRP5YBR237W 2550 nt0.2□□□□□ -2.38
YFL065CP43539 HMRA2YCR096C 360 nt0.2□□□□□ -2.38
YFL065CP43539 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt0.2□□□□□ -2.38
YFL065CP43539 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt0.2□□□□□ -2.38
YFL065CP43539 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt0.2□□□□□ -2.38
YFL065CP43539 CSN9YDR179C 489 nt0.2□□□□□ -2.38
YFL065CP43539 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt0.2□□□□□ -2.38
YFL065CP43539 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt0.2□□□□□ -2.38
YFL065CP43539 COX5BYIL111W 456 nt0.2□□□□□ -2.38
YFL065CP43539 UBP3YER151C 2739 nt0.19□□□□□ -2.38
YFL065CP43539 TAR1YLR154W-C 375 nt0.19□□□□□ -2.38
YFL065CP43539 YLR334CYLR334C 381 nt0.19□□□□□ -2.38
YFL065CP43539 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.19□□□□□ -2.38
YFL065CP43539 YPL185WYPL185W 396 nt0.19□□□□□ -2.38
YFL065CP43539 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.18□□□□□ -2.38
YFL065CP43539 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.18□□□□□ -2.38
YFL065CP43539 RPS25BYLR333C 327 nt0.18□□□□□ -2.38
YFL065CP43539 YPL225WYPL225W 441 nt0.18□□□□□ -2.38
YFL065CP43539 VIK1YPL253C 1944 nt0.18□□□□□ -2.38
YFL065CP43539 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.17□□□□□ -2.38
YFL065CP43539 OST4YDL232W 111 nt0.16□□□□□ -2.38
YFL065CP43539 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.16□□□□□ -2.38
YFL065CP43539 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.16□□□□□ -2.38
YFL065CP43539 YHR138CYHR138C 345 nt0.16□□□□□ -2.38
YFL065CP43539 YPL205CYPL205C 345 nt0.16□□□□□ -2.38
YFL065CP43539 YDL032WYDL032W 312 nt0.15□□□□□ -2.39
YFL065CP43539 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.15□□□□□ -2.39
YFL065CP43539 YJL007CYJL007C 315 nt0.15□□□□□ -2.39
YFL065CP43539 VPS20YMR077C 666 nt0.15□□□□□ -2.39
YFL065CP43539 LEE1YPL054W 906 nt0.15□□□□□ -2.39
YFL065CP43539 snR190snR190 190 nt0.15□□□□□ -2.39
YFL065CP43539 ORC3YLL004W 1851 nt0.15□□□□□ -2.39
YFL065CP43539 PRP42YDR235W 1635 nt0.15□□□□□ -2.39
YFL065CP43539 SEC8YPR055W 3198 nt0.14□□□□□ -2.39
YFL065CP43539 YJR157WYJR157W 363 nt0.14□□□□□ -2.39
YFL065CP43539 OST1YJL002C 1431 nt0.13□□□□□ -2.39
YFL065CP43539 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.13□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.4 ms