Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRATP43155 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRATP43155 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRATP43155 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRATP43155 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRATP43155 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRATP43155 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRATP43155 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRATP43155 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRATP43155 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRATP43155 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRATP43155 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRATP43155 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRATP43155 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRATP43155 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CRATP43155 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRATP43155 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRATP43155 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRATP43155 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRATP43155 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRATP43155 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRATP43155 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRATP43155 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRATP43155 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRATP43155 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRATP43155 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRATP43155 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRATP43155 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRATP43155 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRATP43155 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CRATP43155 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRATP43155 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRATP43155 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRATP43155 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRATP43155 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRATP43155 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRATP43155 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRATP43155 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRATP43155 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRATP43155 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRATP43155 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRATP43155 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRATP43155 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRATP43155 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRATP43155 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRATP43155 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRATP43155 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRATP43155 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRATP43155 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CRATP43155 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CRATP43155 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CRATP43155 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CRATP43155 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CRATP43155 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRATP43155 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRATP43155 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRATP43155 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRATP43155 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRATP43155 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRATP43155 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRATP43155 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CRATP43155 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRATP43155 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRATP43155 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CRATP43155 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CRATP43155 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CRATP43155 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRATP43155 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRATP43155 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRATP43155 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRATP43155 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRATP43155 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRATP43155 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRATP43155 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRATP43155 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRATP43155 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRATP43155 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRATP43155 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRATP43155 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRATP43155 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRATP43155 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRATP43155 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRATP43155 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRATP43155 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRATP43155 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRATP43155 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRATP43155 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRATP43155 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CRATP43155 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRATP43155 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRATP43155 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRATP43155 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRATP43155 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRATP43155 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CRATP43155 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRATP43155 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRATP43155 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRATP43155 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRATP43155 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRATP43155 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms