Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms