Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 BFR2YDR299W 1605 nt0.64□□□□□ -2.31
DDI1P40087 YAP6YDR259C 1152 nt0.64□□□□□ -2.31
DDI1P40087 YKL083WYKL083W 615 nt0.64□□□□□ -2.31
DDI1P40087 CMC4YMR194C-B 222 nt0.64□□□□□ -2.31
DDI1P40087 INP2YMR163C 2118 nt0.64□□□□□ -2.31
DDI1P40087 RPL26AYLR344W 384 nt0.63□□□□□ -2.31
DDI1P40087 YNL058CYNL058C 951 nt0.63□□□□□ -2.31
DDI1P40087 YIR044CYIR044C 186 nt0.62□□□□□ -2.31
DDI1P40087 YAR047CYAR047C 321 nt0.62□□□□□ -2.31
DDI1P40087 YOR282WYOR282W 321 nt0.62□□□□□ -2.31
DDI1P40087 CUL3YGR003W 2235 nt0.62□□□□□ -2.31
DDI1P40087 MRPL50YNR022C 420 nt0.61□□□□□ -2.31
DDI1P40087 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.61□□□□□ -2.31
DDI1P40087 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.6□□□□□ -2.31
DDI1P40087 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.6□□□□□ -2.31
DDI1P40087 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.6□□□□□ -2.31
DDI1P40087 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.6□□□□□ -2.31
DDI1P40087 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.6□□□□□ -2.31
DDI1P40087 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.6□□□□□ -2.31
DDI1P40087 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.6□□□□□ -2.31
DDI1P40087 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.6□□□□□ -2.31
DDI1P40087 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.6□□□□□ -2.31
DDI1P40087 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.6□□□□□ -2.31
DDI1P40087 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.6□□□□□ -2.31
DDI1P40087 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.6□□□□□ -2.31
DDI1P40087 PCF11YDR228C 1881 nt0.6□□□□□ -2.31
DDI1P40087 YDR344CYDR344C 444 nt0.59□□□□□ -2.31
DDI1P40087 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.59□□□□□ -2.31
DDI1P40087 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.59□□□□□ -2.31
DDI1P40087 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.59□□□□□ -2.31
DDI1P40087 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
DDI1P40087 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
DDI1P40087 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.59□□□□□ -2.31
DDI1P40087 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
DDI1P40087 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
DDI1P40087 ECM12YHR021W-A 456 nt0.59□□□□□ -2.31
DDI1P40087 ISF1YMR081C 1017 nt0.59□□□□□ -2.31
DDI1P40087 ATP19YOL077W-A 207 nt0.59□□□□□ -2.31
DDI1P40087 BIR1YJR089W 2865 nt0.58□□□□□ -2.32
DDI1P40087 ATG31YDR022C 591 nt0.58□□□□□ -2.32
DDI1P40087 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.58□□□□□ -2.32
DDI1P40087 MAM33YIL070C 801 nt0.58□□□□□ -2.32
DDI1P40087 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.58□□□□□ -2.32
DDI1P40087 YBR064WYBR064W 429 nt0.58□□□□□ -2.32
DDI1P40087 NOP9YJL010C 2001 nt0.58□□□□□ -2.32
DDI1P40087 ULP2YIL031W 3105 nt0.58□□□□□ -2.32
DDI1P40087 PMP1YCR024C-A 123 nt0.57□□□□□ -2.32
DDI1P40087 YJR011CYJR011C 786 nt0.57□□□□□ -2.32
DDI1P40087 YLL007CYLL007C 1998 nt0.57□□□□□ -2.32
DDI1P40087 NIP100YPL174C 2607 nt0.56□□□□□ -2.32
DDI1P40087 PAU12YGR294W 363 nt0.56□□□□□ -2.32
DDI1P40087 RPS20YHL015W 366 nt0.56□□□□□ -2.32
DDI1P40087 UTP10YJL109C 5310 nt0.56□□□□□ -2.32
DDI1P40087 YML002WYML002W 2214 nt0.54□□□□□ -2.32
DDI1P40087 YCK3YER123W 1575 nt0.54□□□□□ -2.32
DDI1P40087 RPS24BYIL069C 408 nt0.54□□□□□ -2.32
DDI1P40087 RPL38YLR325C 237 nt0.54□□□□□ -2.32
DDI1P40087 YBR206WYBR206W 324 nt0.54□□□□□ -2.32
DDI1P40087 CHS6YJL099W 2241 nt0.54□□□□□ -2.32
DDI1P40087 STE5YDR103W 2754 nt0.54□□□□□ -2.32
DDI1P40087 PTP2YOR208W 2253 nt0.53□□□□□ -2.32
DDI1P40087 NPR2YEL062W 1848 nt0.53□□□□□ -2.32
DDI1P40087 QCR9YGR183C 201 nt0.53□□□□□ -2.32
DDI1P40087 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.53□□□□□ -2.32
DDI1P40087 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.53□□□□□ -2.32
DDI1P40087 MCM10YIL150C 1716 nt0.52□□□□□ -2.33
DDI1P40087 FMP27YLR454W 7887 nt0.52□□□□□ -2.33
DDI1P40087 IQG1YPL242C 4488 nt0.52□□□□□ -2.33
DDI1P40087 OLI1Q0130 231 nt0.52□□□□□ -2.33
DDI1P40087 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.52□□□□□ -2.33
DDI1P40087 YPL044CYPL044C 549 nt0.52□□□□□ -2.33
DDI1P40087 YPL185WYPL185W 396 nt0.5□□□□□ -2.33
DDI1P40087 YLR456WYLR456W 615 nt0.49□□□□□ -2.33
DDI1P40087 BSC3YLR465C 309 nt0.49□□□□□ -2.33
DDI1P40087 THO2YNL139C 4794 nt0.47□□□□□ -2.33
DDI1P40087 YDR426CYDR426C 378 nt0.46□□□□□ -2.34
DDI1P40087 AI1Q0050 2505 nt0.45□□□□□ -2.34
DDI1P40087 YOR218CYOR218C 420 nt0.45□□□□□ -2.34
DDI1P40087 SPO21YOL091W 1830 nt0.43□□□□□ -2.34
DDI1P40087 PAA1YDR071C 576 nt0.43□□□□□ -2.34
DDI1P40087 RPL26BYGR034W 384 nt0.43□□□□□ -2.34
DDI1P40087 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.43□□□□□ -2.34
DDI1P40087 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.43□□□□□ -2.34
DDI1P40087 YLR434CYLR434C 384 nt0.43□□□□□ -2.34
DDI1P40087 ASE1YOR058C 2658 nt0.43□□□□□ -2.34
DDI1P40087 FYV10YIL097W 1551 nt0.42□□□□□ -2.34
DDI1P40087 PCC1YKR095W-A 267 nt0.42□□□□□ -2.34
DDI1P40087 YOL014WYOL014W 375 nt0.42□□□□□ -2.34
DDI1P40087 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.41□□□□□ -2.34
DDI1P40087 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.41□□□□□ -2.34
DDI1P40087 YJL007CYJL007C 315 nt0.41□□□□□ -2.34
DDI1P40087 YSP1YHR155W 3687 nt0.41□□□□□ -2.34
DDI1P40087 YOR053WYOR053W 342 nt0.4□□□□□ -2.35
DDI1P40087 HMRA2YCR096C 360 nt0.39□□□□□ -2.35
DDI1P40087 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.39□□□□□ -2.35
DDI1P40087 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.39□□□□□ -2.35
DDI1P40087 YNL211CYNL211C 261 nt0.39□□□□□ -2.35
DDI1P40087 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.39□□□□□ -2.35
DDI1P40087 YPL068CYPL068C 882 nt0.39□□□□□ -2.35
DDI1P40087 YKL063CYKL063C 504 nt0.38□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.3 ms