Protein–RNA interactions for Protein: P39981

AVT2, Vacuolar amino acid transporter 2, yeastyeast

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT2P39981 SLY1YDR189W 2001 nt0.69□□□□□ -2.3
AVT2P39981 YGR042WYGR042W 816 nt0.68□□□□□ -2.3
AVT2P39981 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.68□□□□□ -2.3
AVT2P39981 YLR202CYLR202C 327 nt0.68□□□□□ -2.3
AVT2P39981 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.68□□□□□ -2.3
AVT2P39981 ISF1YMR081C 1017 nt0.67□□□□□ -2.3
AVT2P39981 YOR199WYOR199W 330 nt0.67□□□□□ -2.3
AVT2P39981 ALY2YJL084C 3141 nt0.67□□□□□ -2.3
AVT2P39981 RKR1YMR247C 4689 nt0.66□□□□□ -2.3
AVT2P39981 AIM44YPL158C 2277 nt0.66□□□□□ -2.3
AVT2P39981 YJR157WYJR157W 363 nt0.66□□□□□ -2.3
AVT2P39981 MRPL50YNR022C 420 nt0.66□□□□□ -2.3
AVT2P39981 Q0017Q0017 162 nt0.66□□□□□ -2.3
AVT2P39981 SLI15YBR156C 2097 nt0.65□□□□□ -2.31
AVT2P39981 YKL202WYKL202W 582 nt0.65□□□□□ -2.31
AVT2P39981 YPL229WYPL229W 621 nt0.65□□□□□ -2.31
AVT2P39981 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.65□□□□□ -2.31
AVT2P39981 RPS24BYIL069C 408 nt0.64□□□□□ -2.31
AVT2P39981 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.64□□□□□ -2.31
AVT2P39981 YPL068CYPL068C 882 nt0.64□□□□□ -2.31
AVT2P39981 PDE2YOR360C 1581 nt0.63□□□□□ -2.31
AVT2P39981 YLR434CYLR434C 384 nt0.63□□□□□ -2.31
AVT2P39981 YOL160WYOL160W 342 nt0.63□□□□□ -2.31
AVT2P39981 YPL205CYPL205C 345 nt0.63□□□□□ -2.31
AVT2P39981 YDL206WYDL206W 2289 nt0.62□□□□□ -2.31
AVT2P39981 MMS4YBR098W 2076 nt0.62□□□□□ -2.31
AVT2P39981 WAR1YML076C 2835 nt0.61□□□□□ -2.31
AVT2P39981 PKH2YOL100W 3246 nt0.61□□□□□ -2.31
AVT2P39981 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.61□□□□□ -2.31
AVT2P39981 RPS20YHL015W 366 nt0.61□□□□□ -2.31
AVT2P39981 YJL007CYJL007C 315 nt0.61□□□□□ -2.31
AVT2P39981 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.61□□□□□ -2.31
AVT2P39981 YOR218CYOR218C 420 nt0.61□□□□□ -2.31
AVT2P39981 YDL196WYDL196W 330 nt0.6□□□□□ -2.31
AVT2P39981 Q0144Q0144 330 nt0.6□□□□□ -2.31
AVT2P39981 RAD34YDR314C 2079 nt0.6□□□□□ -2.31
AVT2P39981 INP2YMR163C 2118 nt0.59□□□□□ -2.31
AVT2P39981 SWF1YDR126W 1011 nt0.59□□□□□ -2.31
AVT2P39981 GPG1YGL121C 381 nt0.59□□□□□ -2.31
AVT2P39981 YNL058CYNL058C 951 nt0.59□□□□□ -2.31
AVT2P39981 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.59□□□□□ -2.31
AVT2P39981 RIM20YOR275C 1986 nt0.58□□□□□ -2.32
AVT2P39981 YDR344CYDR344C 444 nt0.58□□□□□ -2.32
AVT2P39981 YJR011CYJR011C 786 nt0.58□□□□□ -2.32
AVT2P39981 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.58□□□□□ -2.32
AVT2P39981 VPS20YMR077C 666 nt0.58□□□□□ -2.32
AVT2P39981 MAM33YIL070C 801 nt0.57□□□□□ -2.32
AVT2P39981 IES4YOR189W 351 nt0.57□□□□□ -2.32
AVT2P39981 YPL185WYPL185W 396 nt0.57□□□□□ -2.32
AVT2P39981 PRM3YPL192C 402 nt0.57□□□□□ -2.32
AVT2P39981 ATG31YDR022C 591 nt0.56□□□□□ -2.32
AVT2P39981 YDR426CYDR426C 378 nt0.56□□□□□ -2.32
AVT2P39981 YER079WYER079W 633 nt0.56□□□□□ -2.32
AVT2P39981 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.56□□□□□ -2.32
AVT2P39981 YBR064WYBR064W 429 nt0.56□□□□□ -2.32
AVT2P39981 BFR2YDR299W 1605 nt0.56□□□□□ -2.32
AVT2P39981 ALG13YGL047W 609 nt0.55□□□□□ -2.32
AVT2P39981 YPL261CYPL261C 309 nt0.55□□□□□ -2.32
AVT2P39981 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.55□□□□□ -2.32
AVT2P39981 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.55□□□□□ -2.32
AVT2P39981 YBR206WYBR206W 324 nt0.55□□□□□ -2.32
AVT2P39981 YBR285WYBR285W 435 nt0.55□□□□□ -2.32
AVT2P39981 CSN9YDR179C 489 nt0.54□□□□□ -2.32
AVT2P39981 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.54□□□□□ -2.32
AVT2P39981 ECM12YHR021W-A 456 nt0.54□□□□□ -2.32
AVT2P39981 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.54□□□□□ -2.32
AVT2P39981 ULP2YIL031W 3105 nt0.54□□□□□ -2.32
AVT2P39981 TRS65YGR166W 1683 nt0.53□□□□□ -2.32
AVT2P39981 MCM10YIL150C 1716 nt0.53□□□□□ -2.32
AVT2P39981 FMP27YLR454W 7887 nt0.53□□□□□ -2.32
AVT2P39981 CUL3YGR003W 2235 nt0.53□□□□□ -2.33
AVT2P39981 NIP100YPL174C 2607 nt0.52□□□□□ -2.33
AVT2P39981 DBP6YNR038W 1890 nt0.52□□□□□ -2.33
AVT2P39981 YLL007CYLL007C 1998 nt0.52□□□□□ -2.33
AVT2P39981 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt0.52□□□□□ -2.33
AVT2P39981 AGA2YGL032C 264 nt0.51□□□□□ -2.33
AVT2P39981 YKL063CYKL063C 504 nt0.51□□□□□ -2.33
AVT2P39981 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt0.51□□□□□ -2.33
AVT2P39981 LTE1YAL024C 4308 nt0.51□□□□□ -2.33
AVT2P39981 LEE1YPL054W 906 nt0.5□□□□□ -2.33
AVT2P39981 YML002WYML002W 2214 nt0.5□□□□□ -2.33
AVT2P39981 UTP10YJL109C 5310 nt0.5□□□□□ -2.33
AVT2P39981 PAN2YGL094C 3348 nt0.49□□□□□ -2.33
AVT2P39981 OLI1Q0130 231 nt0.49□□□□□ -2.33
AVT2P39981 BSC3YLR465C 309 nt0.49□□□□□ -2.33
AVT2P39981 YNL324WYNL324W 396 nt0.49□□□□□ -2.33
AVT2P39981 ISD11YER048W-A 285 nt0.48□□□□□ -2.33
AVT2P39981 YHL042WYHL042W 453 nt0.48□□□□□ -2.33
AVT2P39981 YHR138CYHR138C 345 nt0.48□□□□□ -2.33
AVT2P39981 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.48□□□□□ -2.33
AVT2P39981 RPL38YLR325C 237 nt0.48□□□□□ -2.33
AVT2P39981 YSP1YHR155W 3687 nt0.48□□□□□ -2.33
AVT2P39981 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.47□□□□□ -2.33
AVT2P39981 YIR044CYIR044C 186 nt0.47□□□□□ -2.33
AVT2P39981 YMR321CYMR321C 318 nt0.47□□□□□ -2.33
AVT2P39981 YOR053WYOR053W 342 nt0.47□□□□□ -2.33
AVT2P39981 PCC1YKR095W-A 267 nt0.46□□□□□ -2.34
AVT2P39981 YAR029WYAR029W 225 nt0.46□□□□□ -2.34
AVT2P39981 YAR053WYAR053W 297 nt0.46□□□□□ -2.34
AVT2P39981 YLR334CYLR334C 381 nt0.46□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27 ms