Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC8P31273 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC8P31273 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms