Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CMPK1P30085 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms