Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTNNA2P26232 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA2P26232 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms