Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF3P17036 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF3P17036 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF3P17036 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF3P17036 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF3P17036 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF3P17036 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF3P17036 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF3P17036 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF3P17036 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF3P17036 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF3P17036 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF3P17036 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF3P17036 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms