Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms