Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGAMP11215 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms