Protein–RNA interactions for Protein: P0DP24

CALM2, Calmodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM2P0DP24 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALM2P0DP24 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALM2P0DP24 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms