Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms