Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CT47B1P0C2W7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CT47B1P0C2W7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CT47B1P0C2W7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CT47B1P0C2W7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CT47B1P0C2W7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CT47B1P0C2W7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CT47B1P0C2W7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CT47B1P0C2W7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CT47B1P0C2W7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CT47B1P0C2W7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CT47B1P0C2W7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CT47B1P0C2W7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms