Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPN1P04843 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPN1P04843 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPN1P04843 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPN1P04843 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPN1P04843 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPN1P04843 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPN1P04843 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPN1P04843 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPN1P04843 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPN1P04843 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPN1P04843 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPN1P04843 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPN1P04843 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPN1P04843 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPN1P04843 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPN1P04843 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPN1P04843 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPN1P04843 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPN1P04843 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPN1P04843 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPN1P04843 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPN1P04843 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPN1P04843 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPN1P04843 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPN1P04843 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPN1P04843 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPN1P04843 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPN1P04843 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPN1P04843 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPN1P04843 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPN1P04843 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPN1P04843 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPN1P04843 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPN1P04843 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPN1P04843 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPN1P04843 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPN1P04843 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPN1P04843 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPN1P04843 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPN1P04843 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPN1P04843 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPN1P04843 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPN1P04843 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPN1P04843 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPN1P04843 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPN1P04843 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPN1P04843 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPN1P04843 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPN1P04843 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPN1P04843 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPN1P04843 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPN1P04843 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPN1P04843 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPN1P04843 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPN1P04843 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPN1P04843 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPN1P04843 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPN1P04843 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPN1P04843 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPN1P04843 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPN1P04843 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPN1P04843 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPN1P04843 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPN1P04843 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPN1P04843 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPN1P04843 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPN1P04843 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPN1P04843 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPN1P04843 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPN1P04843 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPN1P04843 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPN1P04843 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPN1P04843 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPN1P04843 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPN1P04843 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPN1P04843 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPN1P04843 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPN1P04843 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPN1P04843 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPN1P04843 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPN1P04843 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPN1P04843 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPN1P04843 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPN1P04843 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPN1P04843 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPN1P04843 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPN1P04843 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPN1P04843 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPN1P04843 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPN1P04843 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPN1P04843 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPN1P04843 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPN1P04843 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPN1P04843 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPN1P04843 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPN1P04843 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPN1P04843 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPN1P04843 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPN1P04843 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms