Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTNP04004 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTNP04004 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTNP04004 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTNP04004 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTNP04004 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTNP04004 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTNP04004 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTNP04004 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTNP04004 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VTNP04004 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTNP04004 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VTNP04004 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VTNP04004 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VTNP04004 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VTNP04004 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTNP04004 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTNP04004 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTNP04004 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTNP04004 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTNP04004 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VTNP04004 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VTNP04004 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTNP04004 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTNP04004 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTNP04004 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTNP04004 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VTNP04004 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTNP04004 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTNP04004 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VTNP04004 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTNP04004 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTNP04004 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTNP04004 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTNP04004 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTNP04004 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTNP04004 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTNP04004 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTNP04004 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTNP04004 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTNP04004 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VTNP04004 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTNP04004 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTNP04004 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTNP04004 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VTNP04004 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTNP04004 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTNP04004 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VTNP04004 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTNP04004 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTNP04004 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTNP04004 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTNP04004 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTNP04004 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTNP04004 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VTNP04004 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTNP04004 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTNP04004 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTNP04004 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTNP04004 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTNP04004 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTNP04004 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTNP04004 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTNP04004 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTNP04004 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTNP04004 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTNP04004 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTNP04004 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTNP04004 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTNP04004 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTNP04004 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTNP04004 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTNP04004 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTNP04004 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTNP04004 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTNP04004 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTNP04004 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTNP04004 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTNP04004 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTNP04004 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VTNP04004 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTNP04004 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTNP04004 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTNP04004 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTNP04004 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTNP04004 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTNP04004 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTNP04004 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTNP04004 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTNP04004 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTNP04004 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTNP04004 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTNP04004 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTNP04004 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTNP04004 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VTNP04004 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VTNP04004 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTNP04004 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTNP04004 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VTNP04004 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms