Protein–RNA interactions for Protein: O43824

GTPBP6, Putative GTP-binding protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP6O43824 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP6O43824 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP6O43824 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP6O43824 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP6O43824 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP6O43824 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP6O43824 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP6O43824 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP6O43824 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP6O43824 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP6O43824 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP6O43824 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP6O43824 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP6O43824 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP6O43824 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP6O43824 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP6O43824 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP6O43824 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP6O43824 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP6O43824 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP6O43824 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP6O43824 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP6O43824 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP6O43824 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP6O43824 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP6O43824 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP6O43824 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP6O43824 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP6O43824 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP6O43824 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP6O43824 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms