Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms