Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC169A6NNP5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms