Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRCP1A6NGW2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms