Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POTEB3A0JP26 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms