Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 MATR3-229ENST00000361059 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C4BP0C0L5 CHURC1-208ENST00000607599 3615 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C4BP0C0L5 ALKBH8-202ENST00000389568 2491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C4BP0C0L5 NWD1-205ENST00000549814 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C4BP0C0L5 TMCC1-AS1-204ENST00000605830 3496 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C4BP0C0L5 AMYH02020865.1-201ENST00000621140 2591 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C4BP0C0L5 C15orf41-202ENST00000437989 2240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C4BP0C0L5 AL353795.1-201ENST00000439134 1775 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
C4BP0C0L5 SELENOP-209ENST00000511224 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C4BP0C0L5 FLG-AS1-202ENST00000392688 2995 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C4BP0C0L5 KIAA0040-201ENST00000423313 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C4BP0C0L5 AC006141.1-201ENST00000581917 2170 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
C4BP0C0L5 KIF9-AS1-201ENST00000429315 4898 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C4BP0C0L5 PRKG1-203ENST00000373980 6928 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C4BP0C0L5 ARID2-201ENST00000334344 8642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C4BP0C0L5 TTLL4-201ENST00000258398 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C4BP0C0L5 CNTRL-202ENST00000373844 713 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC9.34□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC9.34□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AC011005.4-201ENST00000466717 535 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC9.34□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC9.34□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AC097494.1-201ENST00000512898 732 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 OR5F2P-201ENST00000532761 941 ntBASIC9.34□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC9.34□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 ZNF585A-205ENST00000588354 596 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 ZNF208-202ENST00000597040 781 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC9.34□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC9.34□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 NLK-201ENST00000407008 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 C3P1-202ENST00000497718 4954 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 SOSTDC1-202ENST00000396652 2411 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AL139039.3-201ENST00000413129 1475 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AC067942.1-201ENST00000488045 1493 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 A2ML1-205ENST00000539547 3460 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 MMP10-201ENST00000279441 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 LINC01630-201ENST00000435144 5489 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 OR4D9-202ENST00000641278 6063 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AL353622.1-201ENST00000604716 1945 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 PPP2R5C-218ENST00000556260 2013 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 CCDC85C-201ENST00000380243 16393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 ABCA4-207ENST00000536513 3740 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AL161891.1-201ENST00000621575 4636 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 PSMC2-203ENST00000435765 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 MAPK10-347ENST00000641762 2856 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 MTHFD1-202ENST00000545908 6814 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AC006116.1-201ENST00000587908 2171 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 MUM1L1-201ENST00000337685 4308 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 EEF1A1P26-201ENST00000458319 1363 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AL109924.2-201ENST00000419800 934 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 NPM1P30-201ENST00000425092 828 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AL954705.1-201ENST00000435277 559 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 RNA5SP518-201ENST00000515957 119 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AC137735.1-201ENST00000581911 419 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 NPPA-AS1_1.1-201ENST00000622391 173 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 CR392039.3-201ENST00000623236 227 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 MAPK10-244ENST00000639972 2818 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 CTD-2201I18.1-202ENST00000514042 2705 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 IGSF22-205ENST00000513874 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 EPN2-204ENST00000395620 3860 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 VCAM1-204ENST00000370119 2483 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 DCAF6-202ENST00000367840 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 CNTNAP4-202ENST00000377504 4723 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AC138409.1-201ENST00000505001 3598 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 GPR182-201ENST00000300098 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 PAICS-202ENST00000399688 3297 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 TENM2-207ENST00000520394 8034 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 CACNB2-209ENST00000396576 4464 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 CYB5B-202ENST00000512062 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 CYB5D1-201ENST00000332439 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 ZNF385B-202ENST00000409343 2750 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 GABRR1-202ENST00000435811 3106 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 TP63-203ENST00000354600 4668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 CTH-202ENST00000370938 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 RPL12P1-201ENST00000374520 498 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 MKX-AS1-201ENST00000412244 745 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AP000534.1-201ENST00000444162 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 LINC00533-201ENST00000456103 537 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 DCAF13P2-201ENST00000514188 555 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AC105275.2-201ENST00000567907 711 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AC010980.1-204ENST00000589724 585 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AC124319.3-201ENST00000616832 526 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AC211433.3-201ENST00000623770 375 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
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