Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U3KQE9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
U3KQE9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U3KQE9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
U3KQE9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
U3KQE9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U3KQE9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
U3KQE9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U3KQE9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U3KQE9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
U3KQE9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
U3KQE9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
U3KQE9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U3KQE9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U3KQE9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U3KQE9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
U3KQE9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
U3KQE9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
U3KQE9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
U3KQE9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
U3KQE9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
U3KQE9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
U3KQE9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
U3KQE9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
U3KQE9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
U3KQE9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
U3KQE9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
U3KQE9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
U3KQE9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
U3KQE9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
U3KQE9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
U3KQE9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
U3KQE9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
U3KQE9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
U3KQE9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
U3KQE9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
U3KQE9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
U3KQE9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
U3KQE9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
U3KQE9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
U3KQE9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
U3KQE9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
U3KQE9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
U3KQE9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
U3KQE9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
U3KQE9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
U3KQE9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
U3KQE9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
U3KQE9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
U3KQE9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQE9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQE9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQE9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQE9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQE9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQE9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQE9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQE9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQE9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQE9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQE9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQE9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQE9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQE9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQE9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQE9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQE9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQE9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQE9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQE9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQE9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQE9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQE9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQE9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQE9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
U3KQE9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQE9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQE9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQE9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQE9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQE9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQE9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQE9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQE9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQE9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQE9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQE9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQE9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQE9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQE9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
U3KQE9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQE9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQE9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQE9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQE9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQE9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQE9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQE9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQE9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQE9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms