Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RAD54L2Q9Y4B4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
RAD54L2Q9Y4B4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RAD54L2Q9Y4B4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RAD54L2Q9Y4B4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RAD54L2Q9Y4B4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms