Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
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SH3BP1Q9Y3L3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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SH3BP1Q9Y3L3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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SH3BP1Q9Y3L3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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SH3BP1Q9Y3L3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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SH3BP1Q9Y3L3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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SH3BP1Q9Y3L3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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SH3BP1Q9Y3L3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BP1Q9Y3L3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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SH3BP1Q9Y3L3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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