Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF13BQ9Y275 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF13BQ9Y275 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms