Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF8Q9UPP1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms