Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms