Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK23

NAGPA, N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAGPAQ9UK23 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NAGPAQ9UK23 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAGPAQ9UK23 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms