Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF1

MAGEC2, Melanoma-associated antigen C2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEC2Q9UBF1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEC2Q9UBF1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms