Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms