Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms