Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF41Q9H4P4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF41Q9H4P4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF41Q9H4P4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF41Q9H4P4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF41Q9H4P4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF41Q9H4P4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF41Q9H4P4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF41Q9H4P4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF41Q9H4P4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF41Q9H4P4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF41Q9H4P4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF41Q9H4P4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF41Q9H4P4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF41Q9H4P4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF41Q9H4P4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF41Q9H4P4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF41Q9H4P4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF41Q9H4P4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF41Q9H4P4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF41Q9H4P4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms