Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L4

TMEM60, Transmembrane protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM60Q9H2L4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM60Q9H2L4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms