Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms