Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT23Q9C075 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms