Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms