Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF559Q9BR84 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms