Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TREX2Q9BQ50 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TREX2Q9BQ50 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms