Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms