Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID3AQ99856 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms