Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
PIK3R4Q99570 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms