Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAT1Q99536 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms