Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC7Q96M83 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms